Wpisania dworca do rejestru domagają się trzy stowarzyszenia: Forum Rozwoju Olsztyna, Stowarzyszenie Architektów Polskich oraz Stowarzyszenie Konserwatorów Zabytków. Argumentują, że dworzec stanowi dobry przykład modernizmu. Warmińsko-mazurski wojewódzki konserwator zabytków uznał jednak, że dworzec nie jest dziełem wybitnym i dlatego nie zasługuje na wpis do rejestru. Za zabytki uznał natomiast wiaty na peronach 2, 3 i 4.
Społecznicy zapowiadają, że od decyzji konserwatora odwołają się do ministra kultury.